Ulkusna i neulkisna oboljenja digestivnog trakta (dispepsija) pogađaju milione ljudi širom sveta. Jedan od primarnih uzroka je infekcija bakterijom Helicobacter pylori, koja je prisutna u skoro 75% ovih oboljenja. Drugi glavni uzrok je upotreba nesteroidnih antireumatika (NSAIL), uključujući aspirin. Ovi lekovi sprečavaju aktivnost ciklooksigeneze (COX), enzima odgovornog za održavanje integriteta sluznice u gornjim delovima digestivnog trakta i za podršku protoka krvi do želuca. Uprkos upotrebi modernijih NSAIL, koji uglavnom deluju na drugi oblik ciklooksigeneze (inhibitori COX-2), koji uglavnom dovode do štete na hrskavicama zglobova, takođe su opasni, mada manje, za digestivni trakt.
Istorijski gledano, još 1936. godine, karnozin se koristio za lečenje i prevenciju ulkusa (čira) želuca. Nedavne studije su pokazale da karnozin značajno sprečava formiranje erozija i ulceracija u želucu i dvanaestopalačnom crevu. Karnozin doprinosi da čir bolje zarasta kroz brojne različite mehanizme, uključujući inhibiciju Helicobacter pylori, poboljšanju zarastanja rana, regulaciji inflamatornih citokina, antioksidantivnim efektima i stimulacijom gastrične sekrecije. Može se koristiti kao prirodna mono terapija, alternativa konvencionalnim farmaceutskim proizvodima kao što su inhibitori protonske pumpe, antagonisti H2 receptora ili antibiotici. Takođe se može koristiti kao dodatna terapija u kombinaciji sa konvencionalnim lekovima za čir. Pored toga, pacijenti mogu bezbedno uzimati Karnozin Extra sa NSAIL, kao način za sprečavanje negativnih efekata ovih lekova na želudačnu sluzokožu.